ДНК морской воды
Ученые из Океанариума залива Монтерей, про который мы писали зимой, провели интересное исследование по определению биоразнообразия океана у побережья Калифорнии. Они использовали совершенно новый способ – попытались выделить и расшифровать кусочки ДНК, «плавающие» в морской воде!
Как обычно определяют, какие виды живут в той или иной части океана? Наблюдением за морскими существами и их подсчетом занимаются водолазы – визуально или с использованием фото- и видеосъемки – а потом записывают и обрабатывают результаты наблюдений. Но этот традиционный способ имеет недостатки – например, некоторые рыбы могут не попасться на глаза дайверу ни в один из периодов наблюдения, поскольку активны в другое время суток. А некоторые организмы и вовсе слишком маленькие и незаметные, чтобы их можно было увидеть.
Здесь на сцену выходит eDNA (environmental DNA) – экологическая ДНК или ДНК окружающей среды. Это кусочки генетического материала, которые морские организмы оставили в результате выделений биологических жидкостей (например, слизи) или отслоений кусочков кожи. Если отобрать пробы воды, выделить ДНК и попытаться ее расшифровать, можно определить, какие виды оставили после себя эти следы, и таким образом оценить биоразнообразие участка.
Разумеется, это сложная и трудоемкая работа, и кроме того, не всегда удается найти нужные последовательности ДНК в базе данных, чтобы понять, к какому виду они относятся. Пока что не до конца понятно, насколько далеко может разноситься ДНК в воде – отражает ли она биоразнообразие конкретного участка океана, или может быть принесена издалека? Как долго ДНК рыбы остается в воде неразложенной и сколько времени нужно, чтобы проплывающая мимо рыба оставила после себя достаточно материала, чтобы его можно было найти в экологической ДНК?
Ученые продолжают исследования, чтобы дать ответы на эти вопросы, но уже сейчас понятно, что использование ДНК окружающей среды – это ценный инструмент для изучения биоразнообразия и функционирования морских экосистем. А в будущем – и для мониторинга и прогноза их состояния.

Поля, отмеченные знаком *, обязательны для заполнения.